学校设有3个博士后科研流动站（交通运输工程、电气工程、管理科学与工程），4个一级学科博士点（交通运输工程、管理科学工程🛎、船舶与海洋工程、电气工程），17个一级学科硕士学位授权点🐽，14个专业学位授权类别，53个本科专业♥️。拥有23个省部级重点研究基地。现有1个国家重点（培育）学科，1个上海市高峰学科，2个上海市高原学科🥮，9个部市级重点学科，工程学🦀、计算机科学🏘、社会科学总论🧔♂️、材料科学、环境科学与生态学、化学等6个学科进入ESI全球前1%,港航物流学科保持全球领先。拥有5个国家级特色专业，1个国家级综合改革试点专业，15个国家级一流本科专业建设点，6个教育部卓越工程师教育培养计划专业，17个上海市本科教育高地。现有2个国家级实验教学示范中心，2个国家级虚拟仿真实验教学示范中心🛴，5个国家级工程实践教育中心👩🏻💻，1个全国示范性工程专业学位研究生联合培养基地。1个国家级职业教育“双师型”教师培训基地（水上运输类）🤫💒。1个国家级涉外法治人才协同培养创新基地（培育）。设有水上训练中心🧑🏿💻，拥有4.8万吨散货教学实习船“育明”轮👸🏿。
在2004年教育部本科教学工作水平评估和2006年教育部英语专业教学评估中获得优秀。近年来👏🏿，科技服务能力不断提升，获一批国家级科研项目及部市级以上科技进步奖🛋。
实行校院二级管理体制👰🏻，现设有商船学院🤵🏼♂️🖐🏽、交通运输学院、经济管理学院（上海高级国际航运学院、亚洲邮轮学院）、物流工程学院（中荷机电工程学院）、法学院、信息工程学院、外国语学院🏃🏻♂️➡️、海洋科学与工程学院、理学院、徐悲鸿艺术学院🤏🏼、马克思主义学院🪰、物流科学与工程研究院🧚🏻♂️、体育教学部👨🏻🦯➡️、国际教育学院、继续教育学院、上海港湾学校等二级办学部门。在26000余名学生中，有全日制本科生16000余人，各类在校研究生近8000人😱，留学生600余人🧑🏿🎤。在近1200名专任教师中，有教授近200名🪚。学校致力于培养国家航运业所需要的各级各类专门人才，已向全国港航企事业单位及政府部门输送了逾21万毕业生👨🏿🏭，被誉为“高级航运人才的摇篮”。
